老外筆記

2008/08/23

Firofox 的擴充套件: ScribeFire

ScribeFire 是可用來離線寫部落格用的小程式。是 Firefox 的擴充套件之一。

以前在使用 Windows 時，寫部落格可以用一些網站專用的離線程式寫寫東西，而且是所見即所得的那種。如微軟的 Windows Live Writer、或是Zoundry 等等。而在 Linux 上也有一些很陽春、功能時好時不好的軟體可以用。但 Windows Live Writer 只能在微軟的 My Space 上加東西，對於像是 Blogger 等其他網站的部落格並不支援。而 Zoundry 則是可以寫 Blogger 等眾多知名部落格 (不算台灣知名的無名、樂多、PCHome 和 Pixnet等)。

而在 Mac 上，能用的、而且免費寫在 Blogger 上的似乎就只有 ScribeFire 了 (因為我用 Blogger)。它就和 Zoundry 一樣好用 (可惜 Zoundry 只能在 Windows 上使用)，只不過目前還有些小缺點就是了。像是無法真的貼上照片，雖然它旳功能選單上有貼照片這個欄位；它也無法加上類似「Powered by ScribeFire」的標韱，雖然它同樣有這功能選項 (新的更新已經修正了這個問題)。此外，其他功能對我來說不是很正常就是暫時用不到，所以，寫部落格就非它莫屬了。

2008/08/13

同名同姓又同校

最近民視新聞有個「同名同姓、同分又同校」的消息，見出處。

考高中同分(288分)的兩人，不僅同名同姓(曾薇庭)，還分發到同一所學校(國立武陵高中)。這要多大的緣分才會發生啊，其中一位曾同學的母親還說要認另一位曾同學為乾女兒呢。

這不禁讓我想到我國中分發班級時所發生的類似的事情：
在國一剛開學時有個實力測驗。我這個剛從鄉下跑到大都會區的小子雖然自認不是很頂尖，但是就成蹟來說不至於太差。可是，當考試成蹟出來時，我被分到男生班的第十一班，而全校一年級新生的男生班也不過十三個班而已，每個班級都有約五十個人左右。可想而知，這個消息實在是令人消沉。

第一天上課時，我幾乎快上不下去了。等到班導師來班上點名時發現，班上人數似乎與點名單上顯示的不一樣。於是在一一唱名時才發現多了一個人----我和另外一位和我同名同姓的同學被叫出來詢問誰才是應該留下、誰才要離開？我當時快嚇壞了，心想我的確是有報名考試和註冊的，所以有問題的應該不是我。搞到後來，老師也沒辦法，只得拎著我們兩個人到教務處查查是怎麼一回事？結果發現，是我看錯榜單了，我應該被分到男生第一班。呵呵，頓時間有種從地獄飛到天堂的感覺，在飄飄然了一陣之後才醒來向原來的班導敬了個禮後道謝後走去男生第一班的教室。連我自己看錯和在進教室後因為遲到而被老師唸了一下的事情都變得雲淡風輕了。

而到大學聯考的當年，和我同名同姓的老生一共有五位。這不算什麼。畢竟我不是叫志明、建雄之類的菜市場名字。

今年的北京奧運，大陸跳水女將郭晶晶也很有名，她不但暨上屆奧運得冠後又拿了個第一名的奧運金牌，在中國大陸也同樣也數千名郭晶晶出現呢，見新聞出處。

2008/08/03

我的 Firefox 3 擴充套件

嗯，這一篇應該算是湊字數用的。許多人都喜歡將自己瀏覽器上加的東西都放在部落格上，一來顯擺，二來還能達到推廣的作用。

這是 firefox 的首頁圖案

Firefox 3 在我來說比起其他瀏覽器算是優秀很多。一則記憶體的占用比在 firefox 2 時期還要少，啟動速度和開啟網頁的速度也快很多。加上有很多的擴充套件可以用，又能盡量避免釣魚網頁的影響，比起 Windows 上的 Internet Explorer 和 Apple/Mac 的 Safari 好很多。比它稍差一些的是 Opera 這一款也是跨平台的瀏覽器。

我 Firefox 3 上的擴充套件如下：
Adblock plus --
可以用來擋網頁的廣告，還能設定要擋下哪些個廣告呢。Opera 上可比擬的有 block content。
DownloadHelper --
可以下載網頁上的 flash 動畫或是影片。預設是 .flv 檔。
Easy DragToGo --
可以將選取的文字在原網頁上，輕輕拖動後以自定的搜尋引擎找網頁。或是將連結於分頁或新視窗中開啟。再來是將滑鼠點到的照片以輕輕拖動方式下載到預設目錄底下。
Flashblock --
現在很多網頁上都會放上許多以 flash 制作的廣告。這些東西很煩人又會拖慢網頁速度。使用 flashblock 後就能預先阻擋那些 flash 檔。
Image Toolbar --
這是一個模仿 IE 上的圖片小工具。只要滑鼠移動到照片上，就會有五種選項出現，如下載、檔案資料、列印等等。
Image Zoom --
可以放大或縮小網頁上的圖片。
NoScript --
我是因為安全和開啟網頁速度上考量才使用這套件。主要是可以使網頁不呈現 javascript 或 Java 的內容。至於其他 script，如 Perl 或 PHP 等是否也在阻擋之列我就不曉得了。它也能擋下 adobe flash 及微軟 silverlight 的內容。
PDF download --
下載 PDF 時的小小管理工具。對經常下載 PDF 檔案的研究人員來說算是個不錯的控制工具。
PicLens --
看圖片的超炫工具。尤其是看 Picasa、Flickr和無名正妹牆，更是一大享受。目前並不支援 Linux 系統。
ScribeFire --
離線寫 blog 的套件。我寫 blogger 時就用這東西。不過，目前看來，在從電腦上傳照片一事上還有待改進。
Stop or Reload Button --
將 firefox 的停止和重啟兩個按鈕給統一起來。可以節省空間。
Tab Mix Lite CE --
設定開啟分頁模式的工具。
Web Developer --
網頁開發者的好工具。也是下載防右鍵網頁照片的好物。

當然，除了以上這些之外，還有非常多其他好玩的套件。只是，我不想裝罷了，如果裝太多東西，firefox 就會開始肥了，網頁開啟也會慢下來。

2008/07/27

超音波青蛙

最近亂逛些網頁，看到了個有趣的網站。它是個專門收集期刊新聞的網站叫做 e! Science News，上面以類似網路爬蟲的方法收集科學期刊上的要聞。

今天看到的是一篇談論一種會使用超音波的青蛙，叫做凹耳蛙，是大陸黃山一帶，生活在瀑布那種喧鬧場所的兩生動物。在世界上知道了這種特殊生物存在之後，也特別給了它一個「中國蛙」的別稱。

它有什麼特別的地方呢？

是青蛙都會叫吧？錯！母蛙就不會！不過，那這是指一般青蛙。

一般青蛙在繁殖期間，公蛙都會用宏亮的叫聲來吸引母蛙。宏亮的叫聲表示它「功能正常」、「特別有力」，是公蛙中的公蛙。而凹耳蛙就不只是這樣。它們一樣會叫，可是會叫的不只是公凹眼蛙，還有母凹眼蛙；除了公蛙的一般聲音之外，在繁殖期間，母蛙叫出來的聲音，無論再怎麼大聲，人就是聽不到。(叫人來也沒用不是？)

因為公凹眼蛙的鼓膜演化成可感受超音波的接受器，而且，這還是可以微調的接受器，像是收音機一樣。凹耳蛙的耳朵和一般蛙類不一樣的地方就在於它是凹的。一般生物的身體器官，其形狀都和功能有關係，而經過許多年的研究，凹耳蛙那特別的器官的功能終於在 2006 年時被發表在 Nature 。研究團隊是中國科學院生物物理研究所沈鈞賢教授的實驗室和與其合作的國際友人們。母凹耳蛙會在繁殖期以超音波吸引公凹耳蛙相會，而公凹耳蛙會將平常接收一般聲音狀態的耳朵轉變成只專門接聽母凹耳蛙超音波叫聲的狀態。這樣一來，會聽到的就只是超音波，而少了一般聲音、尤其是嘈雜瀑布聲的干擾。

除了在 2006 年發表令人震驚的論文之外，今年，沈教授的團隊又在 Nature 發表了另外一篇凹耳蛙的論文。有興趣的可以拿那文章拜讀一番。而這個月，在 PNAS 也有一篇相關的文章。我在本文的最後會附上相關內容出處。世人之所以驚訝，並非是因為中國人在 Nature 發表論文，這早就不是新聞了。而是在發現會用超音波傳遞訊息的，除了海豚、鯨魚和蝙蝠等哺乳類之外，還多了個兩生類的凹耳蛙。

從這裡當然就延生了很多問題：一是除了凹耳蛙之然，還有沒有其他的蛙類、甚至是其他動物也會使用超音波來達到溝通的目的？二是會叫出超音波的是母凹耳蛙，而接收超音波的是公凹耳蛙，這是要經過什麼樣的協同演化才能達到傳達訊息的目的？這和收音機和電台得同時發明才能有效果是一樣的意思。另外一個問題就比較玄幻一些，常聽到有人說「功力高的」或是經過訓練的人，可以在吵鬧的環境中只聽到特別的聲音；那人是不是也可以微調自己的聽力到某種程度呢？

嗯，以上是一些雜談。有興趣的，還可以再參考以下的資料：

1. Nature paper 1 (2006)。
2. Nature paper 2 (2008) 或中文摘要。
3. PNAS paper (in press):"Active control of Eustachian tubes confers ultrasonic hearing in frogs"
4. 中科院的新聞。
5. e! Science News 上的介紹。

2008/06/20

桃園龍潭渴望園區

國防生科所在六月十九、二十兩日，在桃園龍潭的渴望學習園區(宏碁)舉辦了第八屆論文研討會兼新生座談會。我參加了論文佈告比賽----這是我今年第三次貼論文佈告了。

這一次研討會，我們班有人參加論文口頭報告比賽(豐正)，不過，內容部分就比其他人要來得少而且比較不完全些，畢竟其他人的都是已發表或是畢業論文了。貼佈告就只有兩個人，我和雅妮。另外還有其他四位認識的人也來貼佈告。我其實對自已的東西能否得獎很沒信心。同實驗室的一位國防生科所學生兼我大學同學瑋倫，也來貼佈告。這算得上是她近年來第一次將實驗成果展示出來和大家分享，很不容易的，因為她的實驗歷程比實驗室其他人還要來得困頓。

渴望園區地方很小，但算得上是五臟俱全了。有吃有住，還有得玩。附近多樹多草皮，還有好幾片的茶樹園。空氣還算不錯，至少比中研院好多了，在這兒，我的鼻子比在台北市還來得自在呢。剛進來就見着許多正在換羽的小白鷺悠閒地在草地上散步。在園區的會議室可以無線上網，很快；而住宿區收到的無線網路訊號就不能，可能是有住戶架上私人 AP 吧。還好還有有線網路可以用，讓我這個半宅男不至於憂慮沒有網路可用。

裡面有一家7-eleven，營業時間真的是早上七點到晚上十一點。今早，我騎著腳踏車在園區和園區附近晃，結果，經常被警衛給擋下。因為這附近還有幾個私人住宅區，沒法乘腳踏車闖進去。被擋下的感覺非常差，不過，私人社區就是有這種規定。

給幾幅園區的圖：

2008/05/30

MAPK 蛋白家族的名稱

我們實驗室並不是研究 kinase 的，對於非 SR protein kinase 的成員，普遍感到陌生，尤其是它們的名稱。在生物界，一個在早期就發現到的基因或蛋白質通常都會有許多的別名 (而且還大量使用名稱縮寫)，大多是因為研究人員對它們有不同的命名，這種情況對於後進人員而言，簡直是一種負擔。
這裡，我根據 NCBI 上 Gene Database 的命名方式給 Mitogen-activated protein kinase (MAPK) 家族的成員來個名稱大匯整，內容可能不完整，不過，也應該夠我用的了。

MAP Kinase Family Members

基本上，它算一目瞭然了，我也懶得多加解釋了。

2008/05/21

Get Firefox 3

Mozilla Firefox 已經開出了第三版的 release candidate, Firefox 3 rc-1。

和第二版最大的差異是網頁瀏覽時的速度提升了很多、已經可以開啟向量圖檔 (如以 SVG 為副檔名的圖)、書簽的管理、前後頁鈕的樣子、安全度提升等等。另外，對於記憶體的使用也變得比較合理。

快下載體驗吧。不過，這時候下載的話，會有一些 add-ons 還來不及更新。

2008/05/18

部落格離線編輯軟體

以往在 Windows 上有 Microsoft 本身的軟體可以寫 Microsoft.com 的 Live 部落格，只是它對其他部落格系統的支援當然不佳。另外，還有個 Zoundry，免費的軟體，支援很多部落格系統，不過大部分台灣常用的如無名、Yahoo! 奇摩等等也沒法子用上。

以上，對我來說都不是問題，因為我用 Blogger。

Zoundry 可以同步化使用者電腦端和 Blogger 上的部落格資料。只是，按照我自已的經驗，Zoundry 在空白行的格式上與 Blogger 還是有些差異的。這很令人傷腦筋。

使用 GNU/Linux 後，這更令人不適應了。每每要寫文章就要上網，這實在是惱人啊。自從安裝了 Wine 後，我也想說裝上 Zoundry 看看是否能讓我多多少少也用一下 Zoundry 寫點東西。不過，結果不順利，到現在我還是無法順利安裝 Zoundry 於 GNU/Linux 上。Kblog 原本還支援 Blogger 的，不曉得為何到了後來就不行了。

我現在只能乖乖地上網用 Firefox 或如本篇文章一樣乖乖地用 Flock 編輯。

2008/05/17

Running GenoPro on Mac

既然可以通過 Wine 在 GNU/Linux 上執行 Windows 上才能跑的 GenoPro，那是否同樣可以用模擬器 (Emulator) 在 MacOS X 上執行 GenoPro 呢？還有我最愛的圖片管理兼編修軟體 Picasa 是否也能通過 Wine on Mac 運作呢？

如果是下載安裝 CrossOver，這問題便似乎可以解決了，不過，CrossOver 應該也和 Wine 一樣不能看做是一種模擬器。灌完後，我可以正常使用 GenoPro 和 Picasa。不過，如同在 GNU/Linux 上需要先灌上 InstallMfcDLL.exe 後再灌 GonoPro 才能正常運作，在 Mac OS-X，CrossOver 灌完後要先灌 InstallMfcDLL.exe 才灌 GenoPro 的 Installer，然後運行 GenoPro 才會成功。而其後的中文顯示和在 GNU/Linux 上的設定一樣。只不過，我還無法解決中文輸入的問題。

2008/05/16

Running GenoPro on Linux

GenoPro 是一款非常好的、很直觀的族譜編寫軟體。它能讓人一眼就看懂族系的來龍去脈。以前在 Windows 使用的時候，我非常喜歡用它來編輯我家的部分族譜。後來轉移作業系統之後，由於還不曉如何在 GNU/Linux 上使用這個原生於 Windows 的出色軟體，因此，數位化族譜的工作就暫時停止了。

以前在其他 GNU/Linux 的平台上，我也曾經試著要灌上 GenoPro。直到現在，我才曉得我可能是少做了某些工作以致於以前用過的 Ubuntu 6.10, Xubuntu 6.10, Fedora Core 6, 和 Fedora 7 等都被我誤會了。

以下就簡單說明我如何在 OpenSuSE 10.3 上使用 GenoPro 這東西。

首先，選定要灌的 GNU/Linux 發行版本，當然，如果能跑上 2007 年之後的版本是最好。之後，再灌新的 Wine （Wine Is Not an Emulator，不是灌酒喔），版本最好是 0.9.6 以後，包括最新的 1.0-rc1版。

再來是下載 GenoPro 的軟體，還有最重要的記得也同時下載 InstallMfcDLL.exe 這個檔案。在執行 GenoPro.exe 之前要先安裝上 InstallMfcDLL.exe。方法是在打開終端機軟體：
進入含有 InstallMfcDLL.exe 的目錄中
打上

wine InstallMfcDLL.exe

讓 Wine 執行 InstallMfcDLL.exe。

最後就是以終端機打開含有 GenoPro 安裝檔 (名稱應該是 GenoPro-installer.exe 之類的) 的目錄，同樣以 Wine 執行 GenoPro 的安裝檔。

之後就能在應用程式的 Menu 上找到 Wine 的分類，在它下面就有已安裝好的 GenoPro 檔，如圖例。