2008/12/05

Specifec Activity of radioactive transcripts

一直以來,計算 in vitro transcribed 出的 RNA 或經由 DNA polymerase 做出的、isotope-labeled DNA 的 specific activity 是我的痛。我一直沒搞清楚為什麼可以由已知 isotope input specific activity (micro-Ci/nmole)、DNA template (nanogram)、和用幾張 filter paper 上點的 isotope 的量 (cpm),計算得到 polymerase 所做出產物的 specific activity (dpm/microgram)。

今天 Lab Meeting 上被電之後,我到圖書館散心找資料,結果意外發現了一個好物,一條計算 specific activity 的公式:



Specific Activity 公式


出自 The condensed protocols from Molecular Cloning (Joseph Sambrook & David W. Russell, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2006) 一書。又是公式,沒錯。在我不應該沒有研究生樣地不想搞清楚 transcript 的 specific activity 到底怎麼得出來的時候,它還挺好用地。
Specific Activity 的單位是 (dpm/μg)。
公式中的其他項目是:
L:input radioactiv label (μCi)
PI:Washed/Unwashed value from DE81 filter paper
m:mass of template DNA (ng)
S:specific activity of input label (μCi/nmole)

而 DE81 filter paper (Whatman) 是要在 0.5M disodium hydrogen phosphate (pH 7.0) 中清洗。而我們 Lab 的 protocol 則是在 0.2M ammonium bicarbonate 中清洗。下次換成前者來洗好了,因為實驗室已經很少在用 DE81 法來計算 specific activity 了,而 protocol 則不曉得是誰抄自何處?

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